根据所移植的造血干细胞来源可将造血干细胞移植分为下述三种： 
     （1）同基因造血干细胞移植（ syngeneic HSCT ， Syn-HSCT ）：在人类只有同卵孪生同胞间的移植为 Syn- HSCT 。 
     （2）异基因造血干细胞移植（ allogeneic HSCT ， Allo-HSCT ）：其供者为非同卵孪生的其他人，如 HLA 配型相合的同胞供者、配型不合的血缘关系（包括 HLA 半相合）供者、配型相合的非血缘关系供者、配型不合的非血缘关系供者四种。  
        （3）自体造血干细胞移植（ autologous HSCT ， Auto-HSCT ）：是将能重建正常造血的自体 HSC 冷冻保存，待该患者接受超大剂量化疗及（或）放射治疗（以下称放疗或化疗）后再将其输回以重建自身造血，所以自体造血干细胞移植实际上是“骨髓避难”或“造血干细胞避难”。